典型的古埃及神庙一般以中轴线为中心，呈南北方向延伸，依次由塔门、立柱庭院、立柱大厅和祭祀殿组成。这种纵深的结构使得神庙可以无限地继续下去。塔门多时达十几道，因为法老们喜欢在前人修建的神庙的基础上增增补补，而塔门又是最易完成的部分。其他部分也显示出累积完成的特点，如卢克索和卡纳克神庙都历经漫长的修筑过程，许多重要的部分是在托勒密时期完成的。古埃及人这种建筑神庙的原则反映出他们“无限延续”的愿望，不仅人的肉体、灵魂永远不灭，神的居所也要不断地延伸下去。
塔门是古埃及神庙最具特色的部分之一。它由对称的东西两个门楼和连接它们的天桥组成，象征东西地平面，是太阳神每天必经之路。塔门上通常有国王高举权杖打击敌人的形象，象征着对一切邪恶势力的巨大威慑力，这种威力迫使它们远离神圣之地。紧靠塔门，通常有国王的巨像或者高耸的方尖碑。自海特西普苏特首创斯芬克斯达到以后，塔门前面铺设一条两侧摆满石像的通道便成为一种惯例。
进入塔门之后，神庙的屋顶逐渐降低，而地面却逐渐增高，到了最深处的祭祀殿中，光线已非常黯淡，气氛也愈加肃静神秘。普通人只能进入立柱庭院，只有国王和大祭司才能到祭祀殿中，那里供奉着神像或国王的雕像，它们深居简出，只在盛大的宗教节日才被抬出神庙与公众见面。在审理重要的案件而难以裁决时，也依赖神旨，看神像点头或摇头断案。
神庙中高大的石柱给人留下深刻的印象。常见的柱头装饰有纸草花式、莲花式、棕榈叶式、哈托尔女神式等等。为了更好地采光，立柱大厅外围的柱子比中间的要低，这是成功地运用“自然采光法”的较早例子。柱子上布满文字和画面，如果保存较好的话，还能看到些微最初的色彩。
神庙中的祭祀活动一是感恩，二是祈求神的帮助，这些都通过一系列烦琐的仪式来完成。日常仪式由大祭司完成，每天早晨他要沐浴净身，然后才能进入祭祀殿，捧出神像，为之焚香涂油，目的是使神恢复生机和活力。在重大的宗教节日，国王亲自主持祭祀活动，以各种颂诗表达对神的感激。
古埃及人对神的崇拜有强烈的功利性，他们认为，神接受人类的供奉，就有责任保佑人们平安幸福，否则人类有权不敬奉他。因此，神不仅享受优美的颂诗，也要倾听民间的疾苦，帮助穷人和受病痛折磨的人。由于这种信念，人们逐渐把神庙拟人化了，神庙里的每样东西都有神性和魔力，他们从神庙的石墙上抠下碎末，当作良药和圣物。也是出于这个原因，国王们喜欢在旧神庙的基础上扩建，以保留其神力。即使不得已要拆除它们，也尽可能把所有的原材料整理出来，用到新建筑中。
因此，神庙有双重面孔：一是现世的神秘威严，一是节庆时的轻松祥和。古埃及人给予神庙“土地拥有者”的地位，使神的概念更具体化。此外，大量经济文献里提到，扩大神庙的物质财富是国王的重要职责之一。
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